Charlotte Fongen har sin solistutdannelse fra Norges Musikkhøyskole, hvor hun tok sin diplom sangutdannelse i 1992. Tidligere studerte hun på Østlandets Musikkonservatorium og ved Barratt Dues Musikkinstitutt. Charlottes sanglærere har bl.a. vært Marit Isene og Anne Nyborg.

Charlotte startet i NRKs Pikekor som 5 åring og sang der i 16 år under ledelse av Marie Foss. Hun var med i mange TV-opptredener, konkurranser, og turneer i Europa og USA.

Charlotte debuterte som sanger med Rikskonsertenes debutstøtte i 1992 og samme høst debuterte hun som solist på Den Norske Opera. Hun har gjort en rekke roller på Den Norske Opera, operaen i Kristiansund og operaer i Danmark. Charlotte er mye brukt som Oriatorie- sanger, og har sunget med de fleste orkestre i Norge.

I 2008 dirigerte hun “Fengselskoret” for TV Norge, og hun har vært dirigent for en rekke kor de siste 20 årene.

Hun er engasjert som pedagog i Dissimilis, og har skrevet “Jenny en annerledes opera”, som ble satt opp på operaen i Bjørvika høsten 2008 med påfølgende tv-seriekulturpris.